L'IAP héberge certains enseignements du Master 2 spécialité « Astronomie, Astrophysique et Ingénierie Spatiale » (AAIS); une partie importante des activités se déroule également à l'Observatoire de Paris (sur les sites de Meudon et de Paris), ainsi qu'à l'Institut d'Astrophysique Spatiale (IAS). Cette formation est commune à l'Observatoire de Paris, à Sorbonne Université, l'Université Paris Cité et l'Université Paris-Saclay.
Un site de présentation synthétique de ce Master 2, à destination des candidats éventuels à cette formation, est disponible à l’adresse http://www2.iap.fr/master2/M2AA/Presentation.html. Le site officiel du Master 2 AAIS est hébergé à l’Observatoire de Paris : http://master-recherche.obspm.fr. Pour toute information complémentaire, on pourra s’adresser au secrétariat ou aux responsables pédagogiques du Master 2, dont les coordonnées sont indiquées sur la page suivante : http://www2.iap.fr/master2/M2AA/Contacts.html.
Par ailleurs, il existe une formation de Master 2 professionnel « Outils et systèmes de l'astronomie et de l'espace » (OSAE). Elle est mise en œuvre par l'Observatoire de Paris, Sorbonne Université, l'Université Paris Cité, l'Université Paris-Saclay et l'ENS Paris-Saclay. Ce Master 2 propose une formation à bac + 5 qui conduit généralement à une entrée immédiate dans la vie active, sans empêcher certaines étudiantes ou étudiants de continuer en thèse. Le but est de valoriser le savoir-faire des astronomes dans la conduite de projets, l'instrumentation de pointe, les techniques numériques etc. Les titulaires d'un tel diplôme deviennent alors ingénieur systèmes ou chef de projets.
L'IAP héberge les enseignements du Master 2 AAIS, et des enseignants-chercheurs et enseignantes-chercheuses de l'institut participent aux enseignements (ainsi que dans une moindre mesure à ceux du Master 2 OSAE).
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